把保函与跟单信用证相比，当事人的权利和义务基本相同，所不同的是跟单信用证要求受益人提交的单据是包括运输单据在内的商业单据，而保函要求的单据实际上是受益人出具的关于委托人违约的声明或证明。这一区别，使两者适用范围有了很大的不同，保函可适用于各种经济交易中，为契约的一方向另一方提供担保。另外，如果委托人没有违约，保函的担保人就不必为承担赔偿责任而付款。而信用证的开证行则必须先行付款。
在招投标过程中，很多招标文件会有如下规定：投标保证金的形式：银行保函。那这个银行保函是什么意思呢？
这里的银行保函是指由银行开具的银行投标保函，由开具的银行以自身信用为担保，向受益人承诺，如果被担保人在投标过程中违反了保函的相关约定，需要缴纳违约金的，则由银行代为缴纳。一般银行保函可以在企业有授信的银行进行办理，如果企业没有银行授信，则可以通过担保公司代办。
履约保函是指：应劳务方和承包方（申请人）的请求，银行金融机构向工程的业主方（受益人）做出的一种履约保证承诺。如果劳务方和承包方日后未能按时、按质、按量完成其所承建的工程，则银行将向业主方支付一笔约占合约金额5%~10%的款项。履约保函有一定的格式限制，也有一定的条件。
预付款保函
是指银行（担保人）应交易合同中的一方当事人（申请人）的请求，开立的以另一方当事人为受益人的保函，在申请人没有履行合同中规定的义务时，银行将保证偿还受益人预付或已付给申请人的金额。