它有以下两个特点：
1、保函依据商务合同开出，但又不依附于商务合同，具有独立法律效力。当受益人在保函项下合理索赔时，担保行就必须承担付款责任，而不论委托人是否同意付款，也不管合同履行的实际事实。即保函是独立的承诺并且基本上是单证化的交易业务。
2、银行信用作为保证，易于为合同双方接受。
由于办理投标保函时要求办理人在该银行有长期、固定的存款，所以银行并没有承担资金风险。但这种方式并没有解决企业资金占用的问题，于是，在银行存有长期固定存款的担保公司，可以为企业代为办理投标保函。即降低了银行的风险，也降低了投标企业的资金占用压力，担保公司也可以获取相应的办理费用作为回报。如果发生违约事件后，银行、担保公司会通过法律手段向违约人进行追讨，这样也加大了违约的成本，降低了违约出现的可能性。
履约保函广泛应用于商品贸易和建筑工程行业，它是指担保银行为卖方或承包商向买方或业主出具的赔款承诺。在卖方或承包商未按基础交易合同约定履行交货或竣工义务的情形下，担保银行应按保函约定向买方或业主赔付相应款项。
预付款保函与履约保函的区别：
履约保函是为了保证中标单位如约履行工程合同的内容
预付款保函是保证在甲方支付了预付款之后能收到合同约定的效果，也即在甲方支付了预付款之后如乙方没有履行合同，银行则将预付款保函的相应押金交还给甲方作为损失补偿。
也就是说这是两个不同的保函，都是要交的。因此从某一个角度也能体现施工单位的经济实力。
不过不用担心，作为预付款的保函既然是为了保证预付款的，就不像履约保函那样一定要到工程全部建设结束，合同内容履行完毕之后才退还给你。通常是约定保证预付款用在合同上就可以退还了。只是在工程建设前期冻结在银行，后面就解冻了。