在采购、工程等项目上体现的比较多。一般的工程项目，甲方为了保障自己的权益，都会要去中标的公司，在签订合同以后，先交一部分保证金到甲方账户，以后一旦发生纠纷，自己的损失会少一点。但是对于一个公司来说，流动资金会关系到公司项目的进度，一般不愿意把大额的钱给到甲方，这个时候就可以通过保函的形式，用保函替代现金交给甲方。保函的出现对于双方其实是一个双赢的事情，甲方利益有保障，乙方也有足够的流动资金运作公司，所以现在很多需要保证金的项目都愿意开具保函，这不限制于工程项目，也包括了采购、招标等等。
关于保函保证金的概念是什么?
保函保证金是指针对银行保证函所支付的保证金。
保函(Letter of Guarantee, L/G)又称保证书，是指银行、保险公司、担保公司或个人应申请人的请求，向第三方开立的一种书面信用担保凭证。保证在申请人未能按双方协议履行起责任或义务时，由担保人代其履行一定金额、一定期限范围内的某种支付责任或经济赔偿责任。 保函即为保证书，为了方便，一般公司及银行都印有一定格式的保证书。其作用包括凭保函交付货物、凭保函签发清洁提单、凭保函倒签预借提单等。
银行保函怎么办理?
一般情况下，办理银行保函有以下步骤:
1、经办人应与业务部门加强沟通，随时掌握企业投标、中标、合同谈判、签约及合同执行每一个环节的情况，熟悉标书及合同中有关银行保函的条款，弄清银行保函的具体要求，必备的担保内容及保函开具及送达后，受理人或受益人应确认的文件。
2、选择保函的开具银行。 经办人要按标书或合同中规定的要求在招标人(业主)可接受的当地银行或者选择在我国的银行抑或其他国际性银行开具保函。选择保函的开具银行时，要符合标书或合同中规定的银行信誉、支付方式的要求。
如果合同中规定业主可用两种货币向承包人结算。那么，在选择担保行时，承包人应注意所选的担保行是否可用二种相应的货币开具保函。另外，经办人还应与所选定的担保行商定保函手续费的取费标准、付款方式、保函所需押金(付款准备金)的存入、抵押形式及数量、币种。
3、正式书面委托银行开具保函时，经办人须送上有关标书或合同文件，并存入必要数量的保证金或办理好有关抵押手续，由担保行根据标书或合同中有关条款正式开具保函。
4、开具保函后，投标人或承包人应及时向招标人、业主送达或通过当地银行代交保函。 保函的递交方式，主要有招标人或承包人亲自递交、邮寄、银行传递等。有的合同规定，招标人或业主为保护自身利益，只接受当地银行开出的保函。
如果委托人与当地银行没有业务往来关系，又无资金存入当地银行时，则可以先在我国或第三国的银行开具保函到当地银行，再由当地银行向招标人或业主签发保函。应注意的是，不管用何种方式递交银行保函，都应该要求招标人或业主等在收到保函后，出具收到保函的证明文件。
5、在保函有效期内，经办人要密切与担保银行的联系，随时向担保银行提供足以证明合同义务履行的文件、资料，要求逐步减少担保金额或注销担保金额。
如有的合同是一次性履行合同义务，当一次性的合同义务履行完毕后，经办人应尽快将有关文件送给担保银行，并声明拒绝招标人的任何索赔，必要时还可要求担保银行通知招标人或业主。
如有的合同是多次履行合同义务的，则每履行完其中一项义务后，经办人就应当向银行提供一次文件(提单、发票、完工证书、验收证明等)，并要求递减担保金额，以拒绝招标人对这一项义务的索赔。企业的业务部门和财务部门应密切配合共同完成这项工作，以防止或减少对外经济合同中产生的不必要纠纷和不应当承担的赔偿。
6、及时注销银行保函。
保函的保证金是银行或者担保公司对申请出具保函的人收取的保证金，此保证金主要是为了约束申请人的某些责任。同时对于在银行办理保函的相关流程也给大家进行了非常详细的介绍，正规情况下，保函的保证金的数额都不会太多的。
保函费
银行保函，又称保证书，是指银行、保险公司、担保公司或担保人应申请人的请求，向受益人开立的一种书面信用担保凭证，保证在申请人未能按双方协议履行其责任或义务时，由担保人代其履行一定金额、一定时限范围内的某种支付或经济赔偿责任。现阶段常用的银行保函为：投标保函、履约保函、支付保函、预付款保函。
银行保函手续费不是统一的，对于不同的银行，不同的保函形式保函的收费是不同的。比如工商银行开具非融资类人民币保函应根据保函风险度按季收取保函金额0.5‰-3‰的手续费。履约保函和预付款保函手续费300元，投标杓函手续费100元，其他类保函手续费100元。对优质客户，经分行审批，可减收手续费。 所以说不能确认具体数额。具体情况具体分析。
保函费指工程合同造价的10%(各银行要求可能不同)的甲方银行支付保函，乙方10%的履约保函以及5%的民工工资保函所产生的费用，如果直接去行办理银行保函，银行会收取手续费，或找担保公司代理，也会产生一定的费用，也可以叫保函手续